Los investigadores del UT Southwestern Medical Center liderarán un consorcio de científicos de múltiples instituciones en un proyecto masivo de cinco años para establecer un centro de intercambio de información de acceso público sobre el sistema inmunológico humano, anunció el hospital el jueves pasado.
Los científicos anticipan que recopilar y asimilar billones de puntos de datos sobre los miles de millones de secuencias utilizadas por los receptores inmunitarios del sistema inmunológico adaptativo conducirá a una mayor comprensión de las enfermedades y sus posibles tratamientos. La base de datos se conocerá como Knowledge Commons del repertorio de receptores inmunes adaptativos (AIRR).
El AIRR contendrá datos e investigaciones sobre el sistema inmunológico adaptativo, centrándose en los receptores de células B y T. Los científicos reconocen que estas células son fundamentales para la respuesta del cuerpo a enfermedades como el cáncer.
La iniciativa será financiada por una subvención de los contribuyentes de 5 millones de dólares emitida por el Instituto Nacional de Alergias y Enfermedades Infecciosas (NIAID).
“El premio demuestra que el NIAID y la comunidad investigadora creen que se trata de un esfuerzo importante. Hemos estado trabajando con nuestros colaboradores durante años para sentar las bases de un gran proyecto como este”, dijo la Dra. Lindsay Cowell, investigadora principal del proyecto, según un comunicado de prensa.
"Creemos que Knowledge Commons puede tener un amplio impacto porque el sistema inmunológico adaptativo desempeña un papel muy importante en el mantenimiento de la salud y en una amplia variedad de enfermedades", dijo.
Los investigadores creen que la combinación de datos sobre varias facetas del sistema inmunológico humano les permitirá obtener una comprensión más holística de cómo la genética, la demografía y el historial de exposición a antígenos pueden afectar la susceptibilidad de una persona a las enfermedades y posiblemente conducir a la optimización de tratamientos como el cáncer. inmunoterapia, vacunas y más, .
“Cuando se integran grandes cantidades de datos, se pueden encontrar conocimientos nuevos y diferentes. Estas son cosas que ningún proyecto de investigación por sí solo puede revelar, pero requieren cientos de estudios juntos para iluminar patrones y comportamientos no observados antes”, dijo Cowell.
Con base en los datos integrados recopilados, los investigadores ejecutarán algoritmos analíticos y predictivos a través del Centro de Computación Avanzada de Texas de la Universidad de Texas, produciendo un gráfico de conocimiento de las relaciones entre los datos.
"Algunas de las operaciones que realizaremos implican billones y billones de cálculos", dijo Scott Christley, director técnico del proyecto. "Esto se llama computación a exaescala y es la vanguardia de lo que se puede calcular hoy".
“Necesitamos supercomputadoras para realizar estos cálculos. Las bases de conocimiento tienen el potencial de acumular más conocimiento del que cualquier persona puede dominar, con un potencial real para aumentar la productividad y la tasa de descubrimiento científico”, dijo Christley.
Otros institutos que participan en el proyecto incluyen el Centro Médico del Hospital Infantil de Cincinnati, el Birkbeck College, la Universidad de Londres en Inglaterra, la Universidad de Louisville, el Instituto La Jolla y la Universidad Bar-Ilan en Israel.
