UT Southwestern Medical Center emitió el siguiente anuncio el 17 de junio
Los científicos de UT Southwestern Medical Center identificaron los dos primeros casos de la variante Beta (B.1.351) de la infección por COVID-19 en el norte de Texas utilizando tecnologías de secuenciación de próxima generación junto con pruebas de PCR dirigidas.
También cabe destacar que la secuenciación más reciente de UT Southwestern demuestra un dominio creciente de las "variantes de interés": Alpha (B.1.1.7), Beta (B.1.351) y Delta (B.1.617). Estas variantes de preocupación representaron el 83 por ciento de las variantes de la semana del 28 de mayo al 3 de junio, en comparación con el 75 por ciento de la semana anterior y el 55 por ciento de la semana anterior.
"A medida que se siguen detectando variantes de preocupación en el norte de Texas y cada vez dominan más, es más importante que nunca que las personas consideren o reconsideren seriamente la vacunación", dice James Cutrell, MD, profesor asociado de medicina interna y director del programa de Enfermedades Infecciosas de UTSW. Programa de becas. “La noticia alentadora es que las vacunas aprobadas parecen estar resistiendo las variantes y ayudan a retrasar la transmisión de todos los tipos de virus mientras protegen contra enfermedades más graves”.
Los protocolos de secuenciación de UT Southwestern muestran que la variante Alpha (B.1.1.7) sigue siendo dominante en el norte de Texas, que se encuentra en aproximadamente el 60 por ciento de las personas muestreadas, seguida de un aumento en la variante Delta (B.1.617), ahora en más del 20 por ciento de individuos muestreados. La variante Beta (B.1.351) se encontró en aproximadamente el 4 por ciento de los individuos muestreados. Ningún individuo dio positivo esta semana para la variante Gamma (P.1) encontrada anteriormente, Epsilon (B.1.429/B.1.427) o la variante Iota (B.1.526), sin embargo, todos excepto la variante Epsilon han sido muestreados previamente.
Para ayudar a rastrear y estudiar COVID-19, UT Southwestern estableció un Biorepositorio de SARS-CoV-2 para recolectar y almacenar siete tipos diferentes de muestras, que incluyen sangre, orina y heces, de pacientes con COVID-19 en la Universidad William P. Clements Jr. Hospital.
Para todas las muestras positivas de COVID-19 recibidas en el laboratorio clínico de UTSW en los últimos meses, UT Southwestern ha secuenciado el virus para detectar cualquier variante conocida, así como posibles nuevas, actualmente alrededor de 120 muestras por mes. Aunque es una muestra relativamente pequeña, la secuenciación en curso brinda una mejor imagen de la frecuencia de cada una de las variantes y la prevalencia de las variantes emergentes, como la variante Beta esta semana. UT Southwestern informó estos hallazgos a los Servicios Humanos y de Salud del Condado de Dallas (DCHHS).
La creciente presencia de la variante Delta en el norte de Texas, que se duplicó con creces al 21 por ciento en las personas muestreadas la semana del 28 de mayo al 3 de junio, es motivo de preocupación porque es más transmisible que la variante original y puede causar una enfermedad más grave. Algunos modelos proyectan que la variante Delta, que actualmente representa alrededor del 10 por ciento de los casos nacionales, se convertirá en la variante dominante en los EE. UU.
Debido a que cada variante tiene diferentes tasas de transmisibilidad, la identificación de las diferentes variantes que aparecen en el norte de Texas es importante para un modelo preciso para predecir la prevalencia, lo que a su vez ayuda a los funcionarios de atención médica a prepararse mejor para los aumentos repentinos, el aumento de las hospitalizaciones y los recursos necesarios. La prevalencia de variantes también puede influir en el tratamiento.
Designación de la OMSLinaje PangoIdentificado por primera vez Categoría de variante
| Alpha | Nacido en 1.1.7 | Reino Unido (09-2020) | Protocolo de Tratamiento |
| Beta | Nacido en 1.351 | Sudáfrica (05-2020) | Protocolo de Tratamiento |
| Gama | P.1 | Brasil (11-2020) | Protocolo de Tratamiento |
| Delta | Nacido en 1.617.2 | India (10-2020) | Protocolo de Tratamiento |
| Epsilon | B.1.427/B.1.429 | Estados Unidos (03-2020) | Interés |
| Zed | P.2 | Brasil (04-2020) | Interés |
| Edad | Nacido en 1.525 | Múltiple (12-2020) | Interés |
| theta | P.3 | Filipinas (01-2021) | Interés |
| Iota | Nacido en 1.526 | Estados Unidos (11-2020) | Interés |
| kappa | Nacido en 1.617.1 | India (10-2020) | Interés |
La secuenciación se realizó en el McDermott Center Next Generation Sequencing (NGS) Core con el análisis realizado por McDermott Bioinformatics Lab, ambos bajo la supervisión de Helen H. Hobbs, MD, investigadora del Instituto Médico Howard Hughes y profesora de medicina interna y genética molecular. , quien dirige el Centro Eugene McDermott para el Crecimiento y Desarrollo Humano en UT Southwestern. Jeffrey SoRelle, MD, instructor asistente de patología, está colaborando con Hobbs proporcionando todas las muestras positivas de COVID-19 analizadas en UT Southwestern y corroborando los resultados con un prueba rápida y enfocada basada en PCR. La colaboración con el McDermott Center Next Generation Sequencing (NGS) Core en UT Southwestern permite la secuenciación completa del genoma completo del virus SARS-CoV-2 en una instalación de última generación que realiza NGS junto con análisis bioinformático. La secuenciación del genoma completo es la mejor manera de monitorear nuevas variantes. Los datos variantes se integrarán en modelos de pronóstico para predicciones epidemiológicas.
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